| 順位 | 住所 | 市区町村 | 地価調査 [1999年] | 順位 (前年比) | ||||
| 用途 | 金額 | 前年比 | 市 | 県 | 全国 | |||
| 1 | 長崎市木場町1390番1外 | 長崎県(林地) | 林地 | 3,090,000 円 | 100 % | 3 | 3 | 14 |
| 2 | 西彼杵郡三和町蚊焼字長阪2675番 | 長崎県(林地) | 林地 | 798,000 円 | 96.03 % | 24 | 24 | 561 |
| 3 | 西彼杵郡時津町子々川郷字原ノ前1877番2 | 長崎県(林地) | 林地 | 720,000 円 | 98.23 % | 11 | 11 | 341 |
| 4 | 佐世保市知見寺町1074番ロ | 長崎県(林地) | 林地 | 711,000 円 | 98.07 % | 13 | 13 | 352 |
| 5 | 西彼杵郡長与町本川内郷字下木場1704番1 | 長崎県(林地) | 林地 | 690,000 円 | 95.83 % | 25 | 25 | 575 |
| 6 | 北松浦郡佐々町小浦免字土肥の浦1120番17 | 長崎県(林地) | 林地 | 590,000 円 | 100.85 % | 2 | 2 | 11 |
| 7 | 大村市宮代町2182番 | 長崎県(林地) | 林地 | 585,000 円 | 94.97 % | 26 | 26 | 677 |
| 8 | 諫早市目代町1698番1 | 長崎県(林地) | 林地 | 496,000 円 | 98.02 % | 16 | 16 | 360 |
| 9 | 西彼杵郡多良見町西川内名字蜂ノ巣1330番6 | 長崎県(林地) | 林地 | 480,000 円 | 96.97 % | 21 | 21 | 480 |
| 10 | 北高来郡飯盛町中山名字長谷1172番1 | 長崎県(林地) | 林地 | 430,000 円 | 98.85 % | 6 | 6 | 280 |
| 11 | 西彼杵郡野母崎町高濱字下廣迫1217番1 | 長崎県(林地) | 林地 | 418,000 円 | 96.09 % | 23 | 23 | 555 |
| 12 | 西彼杵郡琴海町長浦郷字鬼田川内2021番1 | 長崎県(林地) | 林地 | 400,000 円 | 102.04 % | 1 | 1 | 2 |
| 13 | 南高来郡南串山町甲字破石原4861番1 | 長崎県(林地) | 林地 | 398,000 円 | 98.27 % | 10 | 10 | 336 |
| 14 | 西彼杵郡西彼町下岳郷字小ケ倉2317番2 | 長崎県(林地) | 林地 | 376,000 円 | 98.95 % | 5 | 5 | 269 |
| 15 | 西彼杵郡大瀬戸町雪浦小松郷字萩尾ノ向1168番 | 長崎県(林地) | 林地 | 318,000 円 | 99.38 % | 4 | 4 | 249 |
| 16 | 東彼杵郡波佐見町金屋郷字井手ノ平589番2 | 長崎県(林地) | 林地 | 310,000 円 | 98.73 % | 7 | 7 | 298 |
| 17 | 東彼杵郡東彼杵町蕪郷字下広久保1295番2 | 長崎県(林地) | 林地 | 305,000 円 | 98.07 % | 13 | 13 | 352 |
| 18 | 島原市礫石原町甲1212番 | 長崎県(林地) | 林地 | 300,000 円 | 97.4 % | 19 | 19 | 438 |
| 19 | 松浦市調川町松山田免字西728番1外 | 長崎県(林地) | 林地 | 299,000 円 | 98.03 % | 15 | 15 | 358 |
| 20 | 北高来郡高来町西尾名字上荒正津1016番 | 長崎県(林地) | 林地 | 290,000 円 | 97.97 % | 17 | 17 | 373 |
| 21 | 東彼杵郡川棚町上組郷字奥ノ川内西平469番30 | 長崎県(林地) | 林地 | 288,000 円 | 97.96 % | 18 | 18 | 376 |
| 22 | 福江市奥浦町985番1 | 長崎県(林地) | 林地 | 282,000 円 | 97.24 % | 20 | 20 | 453 |
| 23 | 南高来郡瑞穂町西郷戊字大迫1470番1 | 長崎県(林地) | 林地 | 240,000 円 | 96.39 % | 22 | 22 | 528 |
| 24 | 平戸市山中町字大越8番4 | 長崎県(林地) | 林地 | 132,000 円 | 94.29 % | 27 | 27 | 735 |
| 25 | 壱岐郡芦辺町湯岳本村触字清水581番 | 長崎県(林地) | 林地 | 128,000 円 | 98.46 % | 8 | 8 | 320 |
| 26 | 上県郡峰町大字三根字佐賀ノ内1337番14 | 長崎県(林地) | 林地 | 117,000 円 | 98.32 % | 9 | 9 | 331 |
| 27 | 南松浦郡玉之浦町小川郷字椎窪195番11 | 長崎県(林地) | 林地 | 103,000 円 | 98.1 % | 12 | 12 | 349 |