| 順位 | 住所 | 市区町村 | 地価調査 [1999年] | 順位 (前年比) | ||||
| 用途 | 金額 | 前年比 | 市 | 県 | 全国 | |||
| 1 | 熊本市御幸笛田町字石町519番3外 | 熊本市 | 準工業 | 205,000 円 | 96.24 % | 5 | 13 | 625 |
| 2 | 熊本市上南部2-1-115 | 熊本市 | 準工業 | 200,000 円 | 90.91 % | 7 | 18 | 1,133 |
| 3 | 熊本市上熊本3-16-14 | 熊本市 | 準工業 | 168,000 円 | 95.45 % | 6 | 14 | 715 |
| 4 | 熊本市飛田3-2-20 | 熊本市 | 準工業 | 157,000 円 | 98.13 % | 3 | 8 | 441 |
| 5 | 熊本市南高江1-13-8 | 熊本市 | 準工業 | 145,000 円 | 96.67 % | 4 | 10 | 587 |
| 菊池郡西合志町須屋字宿ノ山710番4 | 菊池郡西合志町 | 準工業 | 145,000 円 | 96.67 % | 1 | 10 | 587 | |
| 7 | 菊池郡大津町大津字鍛治ノ上1311番1外 | 菊池郡大津町 | 準工業 | 135,000 円 | 96.43 % | 1 | 12 | 608 |
| 8 | 熊本市戸島町3228番15外 | 熊本市 | 準工業 | 133,000 円 | 100 % | 1 | 1 | 49 |
| 9 | 熊本市下硯川町字昇立2204番2外 | 熊本市 | 準工業 | 118,000 円 | 98.33 % | 2 | 7 | 418 |
| 10 | 八代市宮地町字五反田1780番1 | 八代市 | 準工業 | 105,000 円 | 100 % | 1 | 1 | 49 |
| 11 | 本渡市瀬戸町68番外 | 本渡市 | 準工業 | 104,000 円 | 100 % | 1 | 1 | 49 |
| 12 | 鹿本郡植木町植木字西古屋敷121番5 | 鹿本郡植木町 | 準工業 | 91,000 円 | 93.81 % | 1 | 17 | 921 |
| 13 | 玉名市築地字芝浦436番3外 | 玉名市 | 準工業 | 73,000 円 | 97.33 % | 1 | 9 | 530 |
| 14 | 宇土市松山町字長島931番1外 | 宇土市 | 準工業 | 70,000 円 | 95.24 % | 1 | 15 | 740 |
| 15 | 下益城郡松橋町両仲間字白毛熊65番1 | 下益城郡松橋町 | 準工業 | 59,000 円 | 100 % | 1 | 1 | 49 |
| 16 | 荒尾市万田字平原1111番 | 荒尾市 | 準工業 | 57,500 円 | 100 % | 1 | 1 | 49 |
| 17 | 人吉市下林町字七麦田219番 | 人吉市 | 準工業 | 55,100 円 | 95 % | 1 | 16 | 773 |
| 18 | 菊池市野間口字木ノ本546番1 | 菊池市 | 準工業 | 49,000 円 | 98.99 % | 1 | 6 | 355 |