| 順位 | 住所 | 市区町村 | 地価調査 [1999年] | 順位 (前年比) | ||||
| 用途 | 金額 | 前年比 | 市 | 県 | 全国 | |||
| 1 | 熊本市近見7-3-23 | 熊本市 | 工業地 | 99,000 円 | 99 % | 1 | 16 | 358 |
| 2 | 熊本市御領6-3-57 | 熊本市 | 工業地 | 88,000 円 | 97.78 % | 2 | 20 | 470 |
| 3 | 菊池郡菊陽町大字原水字南下原1368番1 | 菊池郡菊陽町 | 工業地 | 63,000 円 | 95.74 % | 1 | 23 | 595 |
| 4 | 本渡市東町7番7外 | 本渡市 | 工業地 | 51,400 円 | 96.98 % | 1 | 21 | 531 |
| 5 | 牛深市牛深町字後浜3473番3 | 牛深市 | 工業地 | 36,000 円 | 100 % | 1 | 1 | 15 |
| 6 | 山鹿市大字方保田字西の平2861番外 | 山鹿市 | 工業地 | 25,000 円 | 96.15 % | 1 | 22 | 579 |
| 7 | 宇土市岩古曽町字潤川2200番 | 宇土市 | 工業地 | 24,800 円 | 98.02 % | 1 | 18 | 437 |
| 8 | 八代市新港町2丁目2番3外 | 八代市 | 工業地 | 24,500 円 | 98 % | 1 | 19 | 438 |
| 9 | 下益城郡松橋町大字浦川内字当尾12番7 | 下益城郡松橋町 | 工業地 | 20,000 円 | % | 1 | 25 | 782 |
| 菊池郡大津町室字狐平1576番1 | 菊池郡大津町 | 工業地 | 20,000 円 | 99.01 % | 1 | 15 | 356 | |
| 11 | 荒尾市一部字北田850番4 | 荒尾市 | 工業地 | 17,800 円 | 98.89 % | 1 | 17 | 370 |
| 12 | 玉名市大倉字山ノ後467番3外 | 玉名市 | 工業地 | 15,000 円 | 100 % | 1 | 1 | 15 |
| 13 | 水俣市浜松町6-37 | 水俣市 | 工業地 | 14,500 円 | % | 1 | 25 | 782 |
| 14 | 菊池郡旭志村川辺字四ノ東沖1126番7 | 菊池郡旭志村 | 工業地 | 13,300 円 | 100 % | 1 | 1 | 15 |
| 15 | 玉名郡長洲町名石浜5番外 | 玉名郡長洲町 | 工業地 | 13,000 円 | 100 % | 1 | 1 | 15 |
| 阿蘇郡一の宮町大字宮地字南油町4454番8 | 阿蘇郡一の宮町 | 工業地 | 13,000 円 | % | 1 | 25 | 782 | |
| 17 | 人吉市鬼木町字梢山1769番31外 | 人吉市 | 工業地 | 12,500 円 | % | 1 | 25 | 782 |
| 18 | 天草郡姫戸町姫浦字久保881番2外 | 天草郡姫戸町 | 工業地 | 12,000 円 | 100 % | 1 | 1 | 15 |
| 天草郡大矢野町中字池ノ迫5368番2 | 天草郡大矢野町 | 工業地 | 12,000 円 | 100 % | 1 | 1 | 15 | |
| 20 | 菊池郡泗水町吉富字今寺34番1 | 菊池郡泗水町 | 工業地 | 11,300 円 | 100 % | 1 | 1 | 15 |
| 21 | 天草郡河浦町河浦字四反田3126番外 | 天草郡河浦町 | 工業地 | 11,000 円 | 99.1 % | 1 | 14 | 342 |
| 阿蘇郡西原村大字鳥子字梅香口312番2 | 阿蘇郡西原村 | 工業地 | 11,000 円 | 100 % | 1 | 1 | 15 | |
| 23 | 上益城郡甲佐町西寒野字小川島856番 | 上益城郡甲佐町 | 工業地 | 10,100 円 | 100 % | 1 | 1 | 15 |
| 24 | 芦北郡津奈木町小津奈木字男島2120番2 | 葦北郡津奈木町 | 工業地 | 10,000 円 | 94.34 % | 1 | 24 | 653 |
| 球磨郡錦町一武字狩政下2605番13外 | 球磨郡錦町 | 工業地 | 10,000 円 | % | 1 | 25 | 782 | |
| 26 | 八代郡鏡町大字鏡町字郷開1159番3 | 八代郡鏡町 | 工業地 | 9,600 円 | 100 % | 1 | 1 | 15 |
| 27 | 玉名郡南関町下坂下字三反田1683番4 | 玉名郡南関町 | 工業地 | 9,500 円 | 100 % | 1 | 1 | 15 |
| 28 | 宇土郡三角町大字波多字郷開2864番15外 | 宇土郡三角町 | 工業地 | 9,400 円 | 100 % | 1 | 1 | 15 |
| 29 | 球磨郡多良木町多良木字古多良木4036番2 | 球磨郡多良木町 | 工業地 | 7,000 円 | 100 % | 1 | 1 | 15 |