| 順位 | 住所 | 市区町村 | 地価調査 [1999年] | 順位 (前年比) | ||||
| 用途 | 金額 | 前年比 | 市 | 県 | 全国 | |||
| 1 | 熊本市画図町大字重富字道下438番6 | 熊本市 | 区域内 | 149,000 円 | 100 % | 2 | 4 | 83 |
| 2 | 菊池郡菊陽町大字原水字中尾上2927番1外 | 菊池郡菊陽町 | 区域内 | 110,000 円 | 98.21 % | 2 | 22 | 937 |
| 3 | 熊本市秋津町秋田字古屋敷3441番13 | 熊本市 | 区域内 | 100,000 円 | 100 % | 2 | 4 | 83 |
| 4 | 下益城郡富合町古閑字四反田956番1外 | 下益城郡富合町 | 区域内 | 84,000 円 | 101.2 % | 1 | 1 | 35 |
| 5 | 熊本市小山町1808番1 | 熊本市 | 区域内 | 53,600 円 | 100 % | 2 | 4 | 83 |
| 6 | 菊池郡合志町幾久富字山下1619番1外 | 菊池郡合志町 | 区域内 | 51,500 円 | 99.04 % | 2 | 21 | 781 |
| 7 | 熊本市城山半田町字中ノ須129番2 | 熊本市 | 区域内 | 48,800 円 | 100 % | 2 | 4 | 83 |
| 8 | 熊本市平山町3219番1 | 熊本市 | 区域内 | 44,000 円 | 100 % | 2 | 4 | 83 |
| 9 | 菊池郡西合志町御代志字輪渕2009番1 | 菊池郡西合志町 | 区域内 | 41,400 円 | 100 % | 1 | 4 | 83 |
| 10 | 熊本市中無田町字御供田725番外 | 熊本市 | 区域内 | 32,500 円 | 100 % | 2 | 4 | 83 |
| 11 | 上益城郡嘉島町大字井寺字野園1022番3 | 上益城郡嘉島町 | 区域内 | 29,800 円 | 100 % | 1 | 4 | 83 |
| 12 | 菊池郡菊陽町大字久保田字川久保2007番 | 菊池郡菊陽町 | 区域内 | 28,300 円 | 100 % | 1 | 4 | 83 |
| 13 | 上益城郡嘉島町大字上島字南屋敷1292番1 | 上益城郡嘉島町 | 区域内 | 25,000 円 | 99.21 % | 3 | 20 | 743 |
| 14 | 上益城郡益城町島田字東無田屋敷376番 | 上益城郡益城町 | 区域内 | 24,000 円 | 100 % | 1 | 4 | 83 |
| 15 | 熊本市小糸山町字前畑16番2 | 熊本市 | 区域内 | 23,000 円 | 100 % | 2 | 4 | 83 |
| 16 | 熊本市川口町字惟重2605番 | 熊本市 | 区域内 | 21,300 円 | 100.95 % | 1 | 2 | 43 |
| 17 | 上益城郡嘉島町下仲間字庄島1002番3 | 上益城郡嘉島町 | 区域内 | 21,000 円 | 99.53 % | 2 | 19 | 680 |
| 18 | 下益城郡富合町大字釈迦堂字下廻淵422番 | 下益城郡富合町 | 区域内 | 18,700 円 | 100.54 % | 2 | 3 | 58 |
| 19 | 下益城郡富合町志々水字西田614番3 | 下益城郡富合町 | 区域内 | 17,500 円 | 100 % | 3 | 4 | 83 |
| 20 | 荒尾市平山字西浦1930番1 | 荒尾市 | 区域内 | 15,800 円 | 100 % | 1 | 4 | 83 |
| 下益城郡富合町大字榎津字琵琶崎1234番2 | 下益城郡富合町 | 区域内 | 15,800 円 | 100 % | 3 | 4 | 83 | |
| 22 | 菊池郡合志町栄字西原3388番2 | 菊池郡合志町 | 区域内 | 15,000 円 | 100 % | 1 | 4 | 83 |