| 順位 | 住所 | 市区町村 | 地価調査 [2006年] | 順位 (前年比) | ||||
| 用途 | 金額 | 前年比 | 市 | 県 | 全国 | |||
| 1 | 長崎市戸町5丁目666番1外 | 長崎市 | 工業地 | 54,300 円 | 87.16 % | 2 | 10 | 673 |
| 2 | 佐世保市干尽町6番16 | 佐世保市 | 工業地 | 41,400 円 | 93.03 % | 2 | 8 | 568 |
| 3 | 佐世保市相浦町2726番 | 佐世保市 | 工業地 | 39,500 円 | 92.94 % | 3 | 9 | 571 |
| 4 | 諫早市貝津町1830番25 | 諫早市 | 工業地 | 31,900 円 | 98.76 % | 1 | 2 | 143 |
| 5 | 長崎市三京町646番23 | 長崎市 | 工業地 | 31,600 円 | 95.76 % | 1 | 6 | 397 |
| 6 | 大村市富の原2丁目440番1外 | 大村市 | 工業地 | 25,000 円 | 96.9 % | 1 | 4 | 285 |
| 7 | 東彼杵郡東彼杵町三根郷字椎ノ木893番1 | 東彼杵郡東彼杵町 | 工業地 | 20,500 円 | 95.35 % | 1 | 7 | 436 |
| 8 | 雲仙市吾妻町田之平名字石走200番1外 | 雲仙市 | 工業地 | 13,500 円 | 97.83 % | 1 | 3 | 211 |
| 9 | 佐世保市小佐々町黒石517番12外 | 佐世保市 | 工業地 | 9,400 円 | 98.95 % | 1 | 1 | 122 |
| 10 | 北松浦郡江迎町埋立免字新地2番32 | 北松浦郡江迎町 | 工業地 | 8,550 円 | 96.07 % | 1 | 5 | 362 |