| 順位 | 住所 | 市区町村 | 地価公示 [1999年] | 順位 (前年比) | ||||
| 用途 | 金額 | 前年比 | 市 | 県 | 全国 | |||
| 1 | 長崎市浜町8-33 | 長崎市 | 商業地 | 2,820,000 円 | 81.03 % | 18 | 74 | 5,768 |
| 2 | 佐世保市島瀬町9-8 | 佐世保市 | 商業地 | 1,670,000 円 | 83.08 % | 15 | 70 | 5,627 |
| 3 | 佐世保市下京町7-26 | 佐世保市 | 商業地 | 1,200,000 円 | 85.71 % | 14 | 67 | 5,192 |
| 4 | 長崎市五島町1-21 | 長崎市 | 商業地 | 1,090,000 円 | 80.74 % | 19 | 75 | 5,781 |
| 5 | 長崎市油屋町1-14 | 長崎市 | 商業地 | 1,070,000 円 | 82.31 % | 16 | 72 | 5,684 |
| 6 | 長崎市万屋町1-8 | 長崎市 | 商業地 | 940,000 円 | 86.24 % | 11 | 63 | 5,075 |
| 7 | 佐世保市三浦町4-5 | 佐世保市 | 商業地 | 919,000 円 | 90.1 % | 12 | 56 | 3,809 |
| 8 | 佐世保市常盤町6-15 | 佐世保市 | 商業地 | 870,000 円 | 86.14 % | 13 | 64 | 5,111 |
| 9 | 長崎市宝町5-9 | 長崎市 | 商業地 | 755,000 円 | 90.42 % | 7 | 55 | 3,684 |
| 10 | 長崎市中園町6-23 | 長崎市 | 商業地 | 725,000 円 | 82.67 % | 15 | 71 | 5,659 |
| 11 | 長崎市勝山町38番4外 | 長崎市 | 商業地 | 650,000 円 | 81.15 % | 17 | 73 | 5,757 |
| 12 | 佐世保市高砂町4-18 | 佐世保市 | 商業地 | 647,000 円 | 94.18 % | 5 | 41 | 2,256 |
| 13 | 佐世保市山県町1-2 | 佐世保市 | 商業地 | 644,000 円 | 91.35 % | 9 | 51 | 3,334 |
| 14 | 長崎市松山町4-40 | 長崎市 | 商業地 | 570,000 円 | 87.29 % | 9 | 61 | 4,827 |
| 15 | 長崎市文教町9-3 | 長崎市 | 商業地 | 518,000 円 | 86.62 % | 10 | 62 | 5,007 |
| 16 | 諫早市栄町1-5 | 諫早市 | 商業地 | 516,000 円 | 87.61 % | 4 | 60 | 4,746 |
| 17 | 長崎市船大工町1-11 | 長崎市 | 商業地 | 505,000 円 | 84.31 % | 14 | 69 | 5,507 |
| 18 | 長崎市館内町14-10 | 長崎市 | 商業地 | 499,000 円 | 88.01 % | 8 | 59 | 4,603 |
| 19 | 長崎市浜口町6-11 | 長崎市 | 商業地 | 492,000 円 | 85.57 % | 13 | 68 | 5,234 |
| 20 | 長崎市下西山町13-28 | 長崎市 | 商業地 | 405,000 円 | 85.99 % | 12 | 65 | 5,148 |
| 21 | 佐世保市塩浜町7-9 | 佐世保市 | 商業地 | 370,000 円 | % | 16 | 76 | 5,993 |
| 22 | 長崎市曙町3-19 | 長崎市 | 商業地 | 366,000 円 | 96.32 % | 2 | 37 | 1,477 |
| 23 | 佐世保市俵町7-2 | 佐世保市 | 商業地 | 364,000 円 | 91.92 % | 8 | 49 | 3,120 |
| 24 | 佐世保市元町1-12 | 佐世保市 | 商業地 | 355,000 円 | 93.18 % | 7 | 45 | 2,626 |
| 25 | 西彼杵郡時津町浦郷字古川253番5外 | 西彼杵郡時津町 | 商業地 | 344,000 円 | 93.73 % | 1 | 43 | 2,439 |
| 26 | 佐世保市高天町8-3 | 佐世保市 | 商業地 | 329,000 円 | 94 % | 6 | 42 | 2,329 |
| 27 | 長崎市滑石3-19-20 | 長崎市 | 商業地 | 315,000 円 | 93.47 % | 5 | 44 | 2,518 |
| 28 | 佐世保市稲荷町14-4 | 佐世保市 | 商業地 | 269,000 円 | 91.19 % | 10 | 52 | 3,390 |
| 29 | 長崎市田上3-2-11 | 長崎市 | 商業地 | 265,000 円 | 97.43 % | 1 | 30 | 1,081 |
| 30 | 福江市栄町3番5 | 福江市 | 商業地 | 254,000 円 | 92.03 % | 2 | 48 | 3,064 |
| 31 | 西彼杵郡長与町嬉里郷字五反田456番10 | 西彼杵郡長与町 | 商業地 | 237,000 円 | 100 % | 1 | 1 | 24 |
| 32 | 諫早市天満町19-11 | 諫早市 | 商業地 | 231,000 円 | 88.51 % | 3 | 58 | 4,446 |
| 33 | 大村市東本町426番外 | 大村市 | 商業地 | 190,000 円 | 85.97 % | 4 | 66 | 5,154 |
| 34 | 長崎市田中町379番1外 | 長崎市 | 商業地 | 182,000 円 | % | 20 | 76 | 5,993 |
| 35 | 島原市中堀町157番2 | 島原市 | 商業地 | 180,000 円 | 90 % | 2 | 57 | 3,852 |
| 36 | 長崎市深堀町1丁目11番20 | 長崎市 | 商業地 | 170,000 円 | 95.51 % | 4 | 39 | 1,747 |
| 長崎市戸町3丁目2番14 | 長崎市 | 商業地 | 170,000 円 | 96.05 % | 3 | 38 | 1,571 | |
| 38 | 佐世保市日野町853番3 | 佐世保市 | 商業地 | 168,000 円 | 98.82 % | 2 | 24 | 620 |
| 39 | 諫早市東本町6-5 | 諫早市 | 商業地 | 160,000 円 | 93.02 % | 2 | 46 | 2,687 |
| 40 | 松浦市志佐町浦免字立町1293番1外 | 松浦市 | 商業地 | 147,000 円 | 98.66 % | 2 | 27 | 668 |
| 41 | 大村市松並2丁目1219番2 | 大村市 | 商業地 | 141,000 円 | 97.92 % | 2 | 28 | 904 |
| 42 | 平戸市木引田町字木引田町460番 | 平戸市 | 商業地 | 140,000 円 | 99.29 % | 1 | 19 | 474 |
| 43 | 大村市本町453番7 | 大村市 | 商業地 | 136,000 円 | 91.89 % | 3 | 50 | 3,130 |
| 44 | 佐世保市早岐3-2-9 | 佐世保市 | 商業地 | 132,000 円 | 91.03 % | 11 | 54 | 3,446 |
| 45 | 平戸市新町字新町90番1外 | 平戸市 | 商業地 | 126,000 円 | 99.21 % | 2 | 21 | 498 |
| 46 | 北松浦郡佐々町本田原免字沖田141番5 | 北松浦郡佐々町 | 商業地 | 122,000 円 | 100 % | 1 | 1 | 24 |
| 47 | 佐世保市田原町9-31 | 佐世保市 | 商業地 | 119,000 円 | 96.75 % | 3 | 35 | 1,323 |
| 48 | 佐世保市相浦町32番7 | 佐世保市 | 商業地 | 118,000 円 | 96.72 % | 4 | 36 | 1,334 |
| 南高来郡小浜町北本町字馬場田12番1外 | 南高来郡小浜町 | 商業地 | 118,000 円 | 97.52 % | 1 | 29 | 1,041 | |
| 50 | 長崎市畝刈町1613番214 | 長崎市 | 商業地 | 113,000 円 | 91.13 % | 6 | 53 | 3,411 |
| 東彼杵郡川棚町栄町5番6外 | 東彼杵郡川棚町 | 商業地 | 113,000 円 | 100 % | 1 | 1 | 24 | |
| 52 | 福江市福江町481番5外 | 福江市 | 商業地 | 111,000 円 | 92.5 % | 1 | 47 | 2,893 |
| 53 | 佐世保市皆瀬町23番9外 | 佐世保市 | 商業地 | 108,000 円 | 100 % | 1 | 1 | 24 |
| 54 | 諫早市宗方町16番1 | 諫早市 | 商業地 | 107,000 円 | 97.27 % | 1 | 31 | 1,139 |
| 55 | 島原市下川尻町69番 | 島原市 | 商業地 | 105,000 円 | 97.22 % | 1 | 32 | 1,156 |
| 56 | 南高来郡加津佐町己字仲間3091番2外 | 南高来郡加津佐町 | 商業地 | 99,700 円 | 96.8 % | 1 | 34 | 1,306 |
| 57 | 南松浦郡上五島町青方郷字新町2299番 | 南松浦郡上五島町 | 商業地 | 97,900 円 | 99.59 % | 1 | 15 | 414 |
| 58 | 北松浦郡江迎町長坂免字江迎164番27 | 北松浦郡江迎町 | 商業地 | 96,000 円 | 99.28 % | 1 | 20 | 475 |
| 59 | 南松浦郡有川町有川郷字中筋654番1 | 南松浦郡有川町 | 商業地 | 90,400 円 | 99.01 % | 1 | 23 | 567 |
| 60 | 西彼杵郡琴海町西海郷字樋出1700番12 | 西彼杵郡琴海町 | 商業地 | 84,500 円 | 100 % | 1 | 1 | 24 |
| 61 | 南高来郡口之津町甲字田原2710番1外 | 南高来郡口之津町 | 商業地 | 82,000 円 | 98.8 % | 1 | 25 | 627 |
| 62 | 大村市植松2丁目726番21 | 大村市 | 商業地 | 81,500 円 | 100 % | 1 | 1 | 24 |
| 63 | 南高来郡有家町中須川字中小袖220番1 | 南高来郡有家町 | 商業地 | 80,600 円 | 100 % | 1 | 1 | 24 |
| 64 | 西彼杵郡三和町布巻字中ノ間918番4 | 西彼杵郡三和町 | 商業地 | 73,500 円 | 100 % | 1 | 1 | 24 |
| 65 | 西彼杵郡香焼町字田の浦494番16 | 西彼杵郡香焼町 | 商業地 | 71,800 円 | 100 % | 1 | 1 | 24 |
| 66 | 松浦市御厨町里免字坂本309番4外 | 松浦市 | 商業地 | 71,600 円 | 99.44 % | 1 | 17 | 437 |
| 67 | 北松浦郡田平町山内免字日ノ浦360番 | 北松浦郡田平町 | 商業地 | 71,000 円 | 99.3 % | 1 | 18 | 470 |
| 68 | 南高来郡西有家町須川字川向327番5 | 南高来郡西有家町 | 商業地 | 68,600 円 | 98.71 % | 1 | 26 | 653 |
| 69 | 北松浦郡宇久町平郷字船倉2605番6外 | 北松浦郡宇久町 | 商業地 | 60,600 円 | 100 % | 1 | 1 | 24 |
| 70 | 南高来郡国見町土黒甲字源平山44番3外 | 南高来郡国見町 | 商業地 | 60,500 円 | 99.18 % | 1 | 22 | 504 |
| 71 | 東彼杵郡波佐見町折敷瀬郷字立目1777番2外 | 東彼杵郡波佐見町 | 商業地 | 50,300 円 | 100 % | 1 | 1 | 24 |
| 72 | 北松浦郡鹿町町新深江免字駅前29番4 | 北松浦郡鹿町町 | 商業地 | 48,500 円 | 94.36 % | 1 | 40 | 2,191 |
| 73 | 東彼杵郡東彼杵町蔵本郷字蔵本1833番1 | 東彼杵郡東彼杵町 | 商業地 | 46,500 円 | 100 % | 1 | 1 | 24 |
| 74 | 西彼杵郡大島町字間瀬の先1850番1内 | 西彼杵郡大島町 | 商業地 | 42,500 円 | 99.77 % | 1 | 14 | 396 |
| 75 | 南高来郡千々石町乙字犬丸3番11外 | 南高来郡千々石町 | 商業地 | 42,000 円 | 99.53 % | 1 | 16 | 422 |
| 76 | 西彼杵郡崎戸町蛎浦郷字栗崎1777番3 | 西彼杵郡崎戸町 | 商業地 | 20,600 円 | 97.17 % | 1 | 33 | 1,169 |
| 77 | 西彼杵郡伊王島町大字伊王島字仙崎甲3270番1 | 西彼杵郡伊王島町 | 商業地 | 9,650 円 | 100 % | 1 | 1 | 24 |